Resumo A ferrugem da folha, causada por Puccinia triticina, é a ferrugem mais comum do trigo. O fungo é um parasita obrigatório, capaz de produzir urediniósporos infecciosos. Para estudar a estrutura genética da população de ferrugem da folha, 20 primers RAPD foram avaliados em 15 amostras de isolados coletadas no Paquistão. Um total de 105 fragmentos RAPD foram amplificados com uma média de 7 fragmentos por primer. O número de fragmentos amplificados variou de 1 a 12. GL Decamer L-07 e GL Decamer L-01 amplificaram o maior número de bandas (doze), e o primer GL Decamer A-03 amplificou o menor número de bandas, ou seja, um. Os resultados mostraram que quase todos os isolados investigados eram geneticamente diferentes, o que confirma a alta diversidade genética na população de ferrugem da folha. Os esporos de ferrugem podem seguir o padrão de migração em distâncias curtas e longas para áreas vizinhas. Os resultados indicaram que a maior variabilidade foi revelada por 74,9% da diferenciação genética nas populações de ferrugem. Esses resultados sugeriram que cada população não era completamente idêntica e um alto fluxo gênico ocorreu entre a população de ferrugem da folha de diferentes áreas. A maior diferenciação e distância genética entre as populações de ferrugem da folha do Paquistão foram detectadas entre a população de ferrugem da folha no isolado NARC (NARC-4) e AARI-11 e a maior similaridade foi observada entre os isolados NARC (NARC-4) e (NARC-5). O presente estudo mostrou que a população de ferrugem da folha no Paquistão é altamente dinâmica e variável.

Abstract Leaf rust, caused by Puccinia triticina, is the most common rust disease of wheat. The fungus is an obligate parasite capable of producing infectious urediniospores. To study the genetic structure of the leaf rust population 20 RAPD primers were evaluated on 15 isolates samples collected in Pakistan. A total of 105 RAPD fragments were amplified with an average of 7 fragments per primer. The number of amplified fragments varied from 1 to 12. GL Decamer L-07 and GL Decamer L-01 amplified the highest number of bands (twelve) and primer GL Decamer A-03 amplified the lowest number of bands i.e one. Results showed that almost all investigated isolates were genetically different that confirms high genetic diversity within the leaf rust population. Rust spores can follow the migration pattern in short and long distances to neighbor areas. Results indicated that the greatest variability was revealed by 74.9% of genetic differentiation within leaf rust populations. These results suggested that each population was not completely identical and high gene flow has occurred among the leaf rust population of different areas. The highest differentiation and genetic distance among the Pakistani leaf rust populations were detected between the leaf rust population in NARC isolate (NARC-4) and AARI-11and the highest similarity was observed between NARC isolates (NARC-4) and (NARC-5). The present study showed the leaf rust population in Pakistan is highly dynamic and variable.

Abstract Fusarium oxysporum is an entomopathogenic fungus, and it has anti-biological activity against arthropods. Ticks are blood sucking arthropods which are responsible for transmitting different diseases in humans and animals. The use of chemical insecticides against ticks is not eco-friendly option and results in the development of acaricide resistance. Previously, we had cultured a local isolate of Fusarium oxysporum from soil samples which were identified through microscopy and confirmed through molecular technique. In our previous experiments, we have prepared Silver nanoparticles (AgNP) at pH 7 and they had been characterized through X-Ray Diffraction (XRD), UV-visible and zeta-potential. In our current study, the AgNP were prepared at different pH conditions and characterized through Scanning Electron Microscopy (SEM) and Transmission Electron Microscopy (TEM). The protein molecules of F. oxysporum were charged with Ag ions. F. oxysporum NP were observed to enhance anti-biological activity by killing Rhipicephalus microplus and they caused 100% mortality at pH 4 and pH 5 in 24 h in anti-tick biological assay. Our study is the first report to do biological assay against Rhipicehalus ticks by using Fusarium AgNP at acidic pH. Biological control using entomopathogenic fungi can be the best alternative of the chemical method to control the tick population.

Resumo Fusarium oxysporum é um fungo entomopatogênico com atividade antibiológica contra artrópodes. Os carrapatos são artrópodes sugadores de sangue responsáveis pela transmissão de diversas doenças em humanos e animais. O uso de inseticidas químicos contra carrapatos não é uma opção ecologicamente correta e resulta no desenvolvimento de resistência acaricida. Anteriormente, havíamos cultivado um isolado local de Fusarium oxysporum a partir de amostras de solo que foram identificadas por microscopia e confirmadas por técnica molecular. Em nossos experimentos anteriores, preparamos nanopartículas de Prata (AgNP) em pH 7 e elas foram caracterizadas por Difração de Raios X (XRD), UV-visível e potencial zeta. No presente estudo, os AgNP foram preparados em diferentes condições de pH e caracterizados através de Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV) e Microscopia Eletrônica de Transmissão (TEM). As moléculas de proteína de F. oxysporum foram carregadas com íons Ag. Assim, observou-se que F. oxysporum NP aumenta a atividade antibiológica matando Rhipicephalus microplus e causando 100% de mortalidade em pH 4 e pH 5 em 24h no ensaio biológico anticarrapato. Este estudo é o primeiro relato de caso a realizar um ensaio biológico contra carrapatos Rhipicehalus usando Fusarium AgNP em pH ácido. Nesse sentido, é possível concluir que o controle biológico utilizando fungos entomopatogênicos pode ser a melhor alternativa do método químico para controlar a população de carrapatos.

Resumo

Abstract The present study was carried out to determine incidence of overweight and obesity in Pakistani servicemen with reference to their area of duty, feeding habits and also to identify risk factors. Accordingly, 2,501 servicemen selected from all over Pakistan using multiple stage stratified sampling protocol. Nutrition assessment performed using body mass index (BMI), waist to hip ratio (WHR) and dietary assessment using food frequency questionnaire. Collected data was analyzed using the SPSS version 25. Regression was used to find risk factors of obesity and WHR. Results indicated that about 1/4th of servicemen were smokers. Approximately, 1/5th of them were overweight and about one quarter were eating fruits and vegetables for <3 days/ week and <4 days/week, respectively. Only 1/3rd of them were physically active for at least <40 minutes per day. Age and fruits intake were significantly predicting BMI with a direct relation and vegetable intake was negatively correlated to BMI of the servicemen. Age and rank were significant predictors of WHR while, physical activity was negatively correlated to WHR. It is concluded and suggested from our study that there is a need to modify eating patterns and habits as well as improving physical activity on daily basis for healthy and long life of the servicemen.

Resumo Staphylococcus aureus é um importante patógeno de origem alimentar associado à intoxicação alimentar e outras infecções múltiplas em seres humanos. Sua presença em alimentos salgados é um problema sério devido ao seu potencial de tolerância ao sal. Um estudo foi realizado para analisar a presença de enterotoxinas produtoras de resistência a drogas S. aureus em peixes salgados do mar de Gwadar. Amostras recém-perseveradas (n = 50) de peixes salgados foram submetidas à análise da presença de S. aureus usando os primers dos genes 16S rRNA e Nuc. Os isolados foram então avaliados quanto à resistência a drogas e potencial de produção de enterotoxinas usando primers específicos para os genes MecA (gene de resistência à meticilina), (SEA) enterotoxina A estafilocócica e (SEB) enterotoxina B estafilocócica genes. Um total de 13/50 (26%) das amostras foi considerado positivas para a presença de S. aureus, confirmadas preliminarmente com perfis bioquímicos e finalmente com a ajuda da presença de genes-alvo. Os isolados foram encontrados com 100% de resistência à meticilina, os quais foram confirmados molecularmente pela presença do gene MecA no genoma. Os isolados 5/13 (38%) foram positivos para SEA e 3/13 (23%) para genes SEB, enquanto 2/13 (15%) foram confirmados tendo os genes SEA e SEB em seu genoma. Também foi verificado que todos os isolados foram capazes de formar biofilme sobre as superfícies de vidro. Concluiu-se que o estudo confirmou a presença de Staphylococcus aurous resistente à meticilina enterotoxigênica (MRSA) em produtos de peixe salgado, o que representa uma grande preocupação para a segurança alimentar. Medidas preventivas e de controle são necessárias para lidar com essa grave preocupação com a segurança alimentar.

Abstract Staphylococcus aureus is an important foodborne pathogen associated to food intoxication and other multiple infections in human being. Its presence in salted food is a serious issue due to its salt tolerance potential. A study was conducted to analyze the presence of enterotoxins producing drug resistance S. aureus in salted sea fish from Gwadar. Freshly persevered samples (n=50) of salted fish were subjected to analyze the presence of S. aureus using 16S rRNA and Nuc genes primers. The isolates were then evaluated for drug resistance and enterotoxins producing potential using specific primers for MecA (methicillin resistance gene), (SEA) staphylococcal enterotoxin A and (SEB) staphylococcal enterotoxin B genes. Total 13/50 (26%) of the samples were found positive for the presence of S. aureus, preliminary confirmed with biochemical profiling and finally with the help of target genes presence. The isolates were found showing 100% resistant to methicillin, which were molecularly confirmed by the presence of MecA gene present in genome. The isolates 5/13 (38%) were positive for SEA and 3/13 (23%) for SEB genes, whereas 2/13 (15%) were confirmed having both SEA and SEB genes in its genome. It was also confirmed that all the isolates were capable to form biofilm over the glass surfaces. It was concluded that the study confirmed the presence of enterotoxigenic methicillin resistance Staphylococcus aurous (MRSA) in salted fish product, that poses gross food safety concern. Preventive and control measures are necessary to handle this serious food safety concern.

Resumo Esta investigação apresenta a alimentação e a atividade alimentar de bagres ribeirinhos Rita rita ameaçados de extinção, no período de fevereiro de 2017 a janeiro de 2018. Um total de 225 peixes foi analisado quanto ao conteúdo do estômago, caracterizando os itens alimentares dominantes e as características morfométricas. Os resultados apresentaram dez principais itens alimentares consumidos, preferencialmente escamas e ovos de peixes, teleósteos, copépodes, cladóceros, rotíferos e moluscos. O comprimento total e o peso corporal dos peixes variaram entre 9-34 cm (20,53 ± 6,90 cm) e 10-400 g (9125,94 ± 102,07 g), respectivamente. O índice de importância relativa (IRI%) mostrou a importância dos rotíferos sobre os demais itens alimentares. O índice de sobreposição de dieta de Morisita indicou variações sazonais nas dietas de bagres no verão e nas monções, exibindo a menor sobreposição, enquanto a sobreposição máxima ocorreu durante as estações das monções e do inverno. A escala multidimensional não métrica (nMDS) indicou a estreita associação entre os itens alimentares disponíveis durante o verão e o inverno, com uma diferença significativa entre as estações (ANOSIM, R = 0,638, P = 0,013). O índice de amplitude de nicho de Levin foi organizado na ordem de 0,88 > 0,81 > 0,78 > 0,63 > 0,43 para as classes de tamanho de V, IV, III, II e I, respectivamente. O PCA explicou 95,39% da variação total entre os itens alimentares e os grupos de tamanho de peixes. Peixes de pequeno porte apresentaram maior correlação com itens alimentares adequados ao tamanho da boca. Em conclusão, a variedade e a frequência dos itens alimentares registrados indicaram plasticidade alimentar considerável e comportamento alimentar oportunista, com uma mudança da natureza carnívora para onívora. Este estudo pode fornecer informações úteis sobre os hábitos alimentares e de alimentação de R. rita e apresentar subsídios para a preparação de sua dieta em futuras práticas de aquicultura.

Abstract This investigation presents the food and feeding activity of and endangered riverine catfish Rita rita, during February 2017-January 2018. A total of 225 fish individuals was analyzed for stomach contents by characterizing the dominant food items and morphometric features. The results divulged ten major food items consumed, preferably fish scales and eggs, teleost fishes, copepods, cladocerans, rotifers, and mollusks. Total length and body weight of fish varied between 9-34 cm (20.53 ± 6.90 cm) and 10-400 g (9125.94 ± 102.07 g), respectively. The index of relative importance (IRI%) showed the importance of rotifers over the other food items. Morisita’s index of diet overlap indicated seasonal variations in catfish diets with summer and monsoon displaying the least overlap, while maximum overlap during monsoon and winter seasons. The non-metric multidimensional scaling (nMDS) indicated the close association between the food items available during summer and winter seasons with a significant difference among the seasons (ANOSIM, R = 0.638, P = 0.013). Levin’s niche breadth index arranged in the order of 0.88>0.81>0.78>0.63>0.43 for the size classes of V, IV, III, II and I, respectively. The PCA explained 95.39% of the total variance among the food items and fish size groups. Small-sized fish individuals displayed a greater correlation with food items suitable for their mouth size. In conclusion, the variety and frequency of food items recorded indicated considerable feeding plasticity and opportunistic feeding behavior with a shift from carnivorous to omnivorous feeding nature. This study could render useful information on the food and feeding habits of R. rita and provide background for preparing its diet for future aquaculture practices.

Resumo O objetivo principal deste estudo foi investigar as variações sazonais de peixes e crustáceos em relação à composição taxonômica, riqueza de espécies e diversidade no habitat de praias arenosas. Para esse fim, investigamos a área da lagoa Sonmiani Hor durante quatro estações distintas, ou seja, monção nordeste (NE), pré-monção, monção sudoeste (SW) e pós-monção, por um ano. Durante cada transporte, a rede foi puxada cerca de 100 m ao longo da praia, a 0,5 m de profundidade. Os resultados mostraram uma forte correlação linear entre o índice de diversidade e a equitabilidade de peixes (r = 0,978). O índice de diversidade apresentou forte correlação negativa com a abundância e a biomassa (r = -0,978 e -0,972, respectivamente). Os atributos físicos, como temperatura da água da superfície do mar e salinidade, apresentaram forte efeito negativo sobre o conjunto de espécies (r = -0,981 e -0,943, respectivamente). A temperatura média do ar e da água teve uma diferença de aproximadamente 3 °C durante a monção NE e a pré-monção. No entanto, salinidade, pH e condutividade elétrica não apresentaram variabilidade sazonal significativa. A respeito dos índices ecológicos, as espécies de peixes apresentaram maior diversidade (H’ = 3,19) durante a monção SW, enquanto a menor diversidade observada foi na pré-monção (H’ = 1,58). A equitabilidade e a riqueza de espécies, no entanto, permaneceram mais perceptíveis durante a monção SW (J’ = 0,81). O número total de peixes e crustáceos foi de 4.799, com 3.813 peixes e 986 crustáceos. Foram registradas 27 famílias de peixes e 5 famílias de crustáceos, com 30 gêneros e 38 espécies de peixes, além de 10 gêneros e 17 espécies de crustáceos. Liza subviridis apresentou a maior abundância entre as espécies de peixes amostradas. Em conclusão, as espécies de peixes constituíram uma parte significativa da fauna costeira na área de estudo. As variações sazonais apresentaram variações distintas na composição e diversidade das espécies de peixes.

Abstract The primary objective of this study was to investigate the seasonal fish and crustacean variations concerning taxonomic composition, species richness, and diversity in sandy beach habitat. For this purpose, we investigated the Sonmiani Hor lagoon area during four distinct seasons, i.e., northeast (NE) monsoon, pre-monsoon, south-west (SW) monsoon, and post-monsoon for one year. During each haul, the net was pulled about 100m along the beach in 0.5m depth. The results showed a strong linear correlation between the diversity index and equitability in fishes (r = 0.978). The diversity index was strong negatively correlated with the abundance and biomass (r = -0.978, -0.972, respectively). The physical attributes like sea surface water temperature and salinity showed a strong negative effect on species assemblages (r = -0.981 and -0.943, respectively). The mean air and water temperature illustrated approximately 3°C difference during NE and pre-monsoon seasons. However, salinity, pH, and electrical conductivity did not show any significant seasonal variabilities. Under the ecological indices, the fish species displayed higher diversity (H’ = 3.19) during SW monsoon, whereas the lowest diversity was observed during pre-monsoon (H’ = 1.58). The equitability and species richness, however, remained more noticeable during SW monsoon (J’ = 0.81). The total number of individuals of fish and crustaceans reached 4799 with 3813 fish individuals and 986 individuals of crustaceans. A total of 27 families of fish while five crustacean families comprising of 30 genera and 38 fish species while ten genera and 17 species of crustaceans were recorded. Liza subviridis displayed the highest abundance among the sampled fish species. In conclusion, fish species constituted a significant part of the coastal fauna in the study area. The seasonal variations displayed distinct variations in fish species composition and diversity.

RESUMO: Neste estudo, foi feita uma análise fitoquímica e do potencial antifúngico in vitro de frutos, folhas e caule de Lantana camara L. A análise fitoquímica indicou a presença de alcaloides, flavonoides, taninos, saponinas, glicosídeos e terpenoides em frutos, caule e folhas de L. camara. A atividade antifúngica in vitro de frutos, caule e folhas de L. camara foi testada contra Colletotrichum gloeosporioides Penz. Diferentes concentrações (1-5%) do extrato metanólico de todas as partes selecionadas de L. camara foram aplicadas in vitro contra o fungo de teste. Os resultados do experimento in vitro revelaram que a maior concentração do extrato metanólico da fruta (5%) reduziu significativamente a biomassa de C. gloeosporioides em até 66%. Esse extrato eficaz de L. camara foi dividido em seções com n-hexano, clorofórmio, acetato de etila e n-butanol. A bioatividade dessas frações foi testada contra C. gloeosporioides. Os testes mostraram que a concentração de 0,5% da fração de n-hexano do extrato metanólico da fruta causou a maior redução (45%) no crescimento de colónias radial do fungo de teste. Essa fração eficaz de n-heaxane foi selecionada por análise GC-MS para identificar vários compostos antifúngicos possíveis. Ciclopropano, ácido carboxílico, ácido 5-heptônico, 2,2-dimetil-1-4-pentenoato e 2-Propilocta-hidro-1-benzotiofeno foram identificados com os principais compostos. Esse estudo pode concluir que o fruto de L. camara compreendido de compostos de bioativos que possuem atividade antifúngica contra C. gloeosporioides.

ABSTRACT: In the current study phytochemical analysis and in vitro antifungal potential of fruits, leaves and stem of Lantana camara L. were studied. The phytochemical analysis indicated the presence of alkaloids, flavonoids, tannins, saponins, glycosides and terpenoids in fruit, stem and leaves of L. camara. The in vitro antifungal activity of fruit, stem and leaves of L. camara was tested against Colletotrichum gloeosporioides Penz. Different concentrations (1-5%) of methanolic extract of all the selected parts of L. camara were applied in vitro against the test fungus. The results of in vitro experiment revealed that higher concentration of methanolic fruit extract (5%) significantly reduced the biomass C. gloeosporioides up to 66%. This effective extract of L. camara was partitioned with n-hexane, chloroform, ethyl acetate and n-butanol. The bioactivity of these fractions was tested against C. gloeosporioides. The trials showed that 0.5% concentration of n-hexane fraction of methanolic fruit extract caused the highest reduction (45%) in the radial colony growth of the test fungus. This effective n-hexane fraction was selected for GC-MS analysis to identify various possible antifungal compounds. Cyclopropane, carboxylic acid, 5-heptonic acid, 2,2-dimethyl1-4-pentenoate and 2-Propyloctahydro-1-benzothiophene were identified as major compounds. This study can be concluded that L. camara fruit comprised of bioactive compounds which possess antifungal activity against C. gloeosporioides.

RESUMO A mangueira (Mangifera indica) é uma das árvores mais importantes do mundo, cultivadas principalmente nos países tropicais e subtropicais. A antracnose, causada pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides , é a doença mais prejudicial, que causa a redução do número de flores e perdas de rendimento da manga. O presente estudo foi desenvolvido para avaliar a atividade antifúngica de extratos de Datura metel contra C. gloeosporioides. Extratos (1% a 3%) de diferentes partes de D. metel viz. folhas, sementes e raízes foram avaliados quanto ao potencial antifúngico. O extrato metanólico de sementes de D. metel apresentou o maior potencial antifúngico contra o fungo de teste. Todas as concentrações aplicadas reduziram com eficácia o crescimento do fungo de teste. No entanto, o extrato metanólico de sementes na concentração de 1,5% apresentou redução máxima (80%) em relação ao controle. Este extrato foi ainda submetido a fraccionamento utilizando vários solventes orgânicos viz. n-hexano, clorofórmio, acetato de etila e n-butanol. A fração de clorofórmio mostrou ser a melhor para a inibição do fungo-alvo, após análise por meio de GC-MS, e foram identificados vários constituintes bioativos, por exemplo, ácido n-hexadecanóico, fitol, ácido octadecanóico, ácido oleico, o-xileno e ciclo hexanol.

ABSTRACT Mango (Mangifera indica) is one of the most important trees grown mainly in the tropical and subtropical countries. Anthracnose disease caused by Colletotrichum gloeosporioides, is the most damaging disease causing reduction of flower set and yield losses in mango. The present study was designed to evaluate antifungal activity of Datura metel extracts against C. gloeosporioides. Extracts (1% to 3%) of different parts of D. metel viz. leaves, seeds and roots were assessed for their antifungal potential. Methanolic seed extract of D. metel depicted the highest antifungal potential against the test fungus. All the applied concentrations effectively reduced growth of the test fungus. However, 1.5% conc. of methanolic seeds extract showed maximum reduction (80%) in comparison with control. This extract was further subjected to fractionation using various organic solvents viz. n-hexane, chloroform, ethyl acetate and n-butanol. Chloroform fraction was proved to be the best for the inhibition of the target fungus that was analyzed by GC-MS and various bioactive constituents like n-hexadecanoic acid, phytol, octadecanoic acid, oleic acid, o-xylene and cyclohexanol were identified.

RESUMO Foram selecionadas folhas de Chenopodium album, para avaliação do potencial antifúngico contra o Ascochyta rabiei, agente causal da praga do grão de bico. Diferentes concentrações do extrato metanólico das folhas de C. album (1%, 2.5%, 4%, 5.5% e 7%) foram testadas contra o fungo-alvo A. rabiei. Foi observada máxima redução (68%) na biomassa do fungo testado na concentração de 7%. O extrato metanólico das folhas foi particionado, e as frações n-butanol, clorofórmio, n-hexano, acetato de etila foram isoladas de acordo com a polaridade. A atividade antifúngica in vitro dessas frações foi analisada por meio do método de diluições em série. A fração n-hexano apresentou o maior potencial antifúngico, com 55% de inibição na biomassa do fungo testado; por isso, essa fração foi selecionada para análise de Cromatografia Gasosa acoplada à Espectrometria de Massas (GC-MS). Um total de treze compostos identificados nesta análise pertenciam às classes hidrocarbonetos aromáticos, hidrocarbonetos, ácidos graxos saturados, ácido carboxílico aromático, siloxanos, fosfonatos e glicosídeos cardíacos. Estes compostos são, possivelmente, responsáveis pela atividade antifúngica de C. album.

ABSTRACT Chenopodium album, leaves were selected to evaluate their antifungal potential against Ascochyta rabiei causative agent for chickpea blight. Different concentrations of methanolic extract of C. album leaves i.e. 1%, 2.5%, 4%, 5.5% and 7% were tested against the target fungus A. rabiei. Maximum reduction in the test fungal biomass (68%) was observed in 7% concentration. This methanolic leaf extract was partitioned and n-butanol, chloroform, n-hexane, ethyl acetate fractions were isolated according to their polarity. In vitro antifungal activity of these fractions was studied by serial dilution method. n-hexane fraction exhibited the highest antifungal potential with 55% inhibition in test fungal biomass, so this fraction was selected for Gas chromatography mass spectrometry (GC-MS) analysis. Total thirteen compounds identified in this analysis belonged to class aromatic hydrocarbons, hydrocarbons, saturated fatty acids, aromatic carboxylic acid, siloxanes, phosphonates and cardiac glycosides. These compounds might be responsible for antifungal activity of C. album.